Diários de uma Apotecária segue a história de Maomao, uma jovem especialista em remédios e venenos que é sequestrada e vendida como serva para o Palácio Imperial. Tentando passar despercebida, ela acaba usando seus conhecimentos em química para desvendar um mistério envolvendo a saúde dos herdeiros do Imperador. Seu talento chama a atenção do influente oficial Jinshi, transformando Maomao em uma sagaz investigadora de intrigas, envenenamentos e segredos da corte.